Josefs roterom

JosefK
AZT 23.11.2023 kl 14:22 15481


Her planlegger jeg å dumpe alt nytt, forhåpentligvis nyttig, morsomt, interessant -stryk det som ikke passer. Jeg leser en masse og ofte glemmer jeg hvor, hva og med hvem. Med litt fokus, så blir jeg et ordensmenneske 🤓

Kriterier for å oppnå en plass på roterommet:

-Det må kunne relateres direkte eller indirekte til verdens koseligste ensym spesialist -AZT.
-Fortrinnsvis med kommersielt tilsnitt, men finner jeg morsomme ting så havner de også her.
-Jeg er lei av PE, kurs, pissredde studenter som er to prosent minus og synes TA ser skummel ut -tråden er derfor lukket.
-Fortrinnsviss vitenskapelige artikler, men anything goes! Finner jeg en doktorgradsavhandling, et produktblad, en poster eller annet som pirret nysgjerrigheten, det kan komme til å havne her, det og! Jeg kan til og med finne på å rote fram konkurrenters publikasjoner om der er interessant…

JosefK
09.04.2024 kl 07:37 4687

Annello virus tipper jeg der er få som har hørt om. I denne pre printen demonstrerte de tilsvarende performance som AAV9.

Det er kanskje fler som har hørt om Ring Therapeutics (meg selv er en av dem)

Men alle har vel fått med seg M-SAN? Hvis ikke, kan du lære mer om tre ting samtidig med å lese mer her:

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.27.586964v1.full

#annellovector
#M-SAN
#Ring Therapeutics
JosefK
11.04.2024 kl 18:22 4474


Jeg måtte dra litt på smilebåndet når jeg fant denne patentsøknaden. En metode for å påvise biologiske stridsmidler er det ikke så ofte man snubler over, men i dag var altså dagen. Og det minner meg om at Jethro nevnte noe om det, men om det var dette han siktet til, det er slett ikke sikkert. Det som imidlertid er sikkert er at de beskriver bruk av dsDNAse.

Firmaet patentet er registrert på, Path Spray LTD, er så hemmelig at jeg ikke finner noen hjemmeside. Men jeg finner dem i den britiske varianten av Brønnøysund registrene 🤭

#dsdnase
#ABC

https://www.sumobrain.com/patents/wipo/Compositions-detecting-biological-agents/WO2024074847A1.html

JosefK
15.04.2024 kl 21:08 4274


Igjen skulle jeg ønske jeg hadde tilgang til et universitetsbibliotek…. For da hadde jeg finlest denne e-boken:

https://link.springer.com/book/10.1007/978-3-031-28489-2#page=136

Siden jeg ikke har det, får jeg nøye meg med vignetten fra Google:

… Recovery during the lysis step can be improved by the addition of a salt-tolerant nuclease (ArcticZymes Technologies SAN HQ). This enzyme is active at high salt …

Ikke imponert enda? To av forfatterne er fra Boehringer Ingelheim, en fra Boehringer Ingelheim/viratherapeutics og en fra ingen ringere enn Hoffmann LaRoche.

JosefK
18.04.2024 kl 15:52 4083

10x genomics er en gammel kjenning og har en rekke patent der de bruker ulike AZT produkt. De har publisert patent med samme tittel tidligere. Men her nevner de ArcticZymes proteinase 25 ganger mot 17 ganger tidligere. Om det er det samme er jeg slett ikke sikker på, til tross for at tittelen er den samme. Uansett, de er glad i Proteinasen 🤗

#Proteinase
#10x genomics

https://www.sumobrain.com/patents/usapp/Compositions-methods-using-fixed-biological/20240125772.html

En ting til. 10x er et spennende selskap. De taper penger som en full sjømann, men det er absolutt verdt å se på hva de surrer med. Og verdien er omtrent 20 ganger AZT for tiden 🙄

https://s28.q4cdn.com/592666581/files/doc_presentations/2024/01/2024-TXG-JPM-Healthcare-Presentation-vF.pdf
Redigert 18.04.2024 kl 16:17 Du må logge inn for å svare
JosefK
25.04.2024 kl 21:01 3908

DNAe diagnostics har jeg dekt tidligere i denne tråden. Og i dag dukket det opp en ny patent søknad fra dem. Denne gang handler det om Clonal Amplification, som er tittelen på papiret. Også her beskriver de bruk av ISOPOL BST+.

#DNAe diagnostics
#Isopol

https://www.sumobrain.com/patents/wipo/Clonal-amplification/WO2024084249A1.html

Addendum:
Jeg måtte repetere litt om hva som skjedde sist kvartal og boooom, så så jeg hvor denne opplysningen hører hjemme. Slå opp på slide 14 i presentasjonen så finner du den nederst i Høyre hjørne. Stikkord: clonal amplification.

https://assets-global.website-files.com/64c25a874bf82d94feb670d6/65bf948c62ed5413a329c8bb_2023-Q4-results-AZT-presentation.pdf


Redigert 29.04.2024 kl 22:13 Du må logge inn for å svare
JosefK
16.05.2024 kl 13:38 3595


En liten preprint fra et up-and-coming selskap kalt Ultragenyx. De var såpass interessant jeg ble sittende og lese pipeline og regnskap.

#SAN
#AAV

https://www.cell.com/molecular-therapy-family/methods/pdf/S2329-0501(24)00082-2.pdf

https://www.ultragenyx.com/
JosefK
18.05.2024 kl 23:42 3392


En Orginal JosefK investigation.

1. Benjamin E Deverman. Merk dere det navnet. Dere kan lese om han hos arbeidsgiveren her: https://www.broadinstitute.org/bios/ben-deverman

Ben spesialiserer seg på AAV vektorer beregnet på å penetrere blod-hjerne barrieren. Og de som har lest mine tidligere tråder om Broad institute vil vite at de digger å bruke SAN. Det kan alle teste vet å Google: Benjamin E Deverman “salt active nuclease” Masse Treff.

2. Det neste dere kan merke dere er Voyager Therapeutics.

Her kan man egentlig bare la Google gjøre jobben Google: Benjamin E Deverman “voyager therapeutics” igjen, Masse treff. Bl a dette:

«Recently, the company announced the publication from the California Institute of Technology (Caltech) in Nature Neuroscience of new preclinical data from ongoing efforts of Dr. Benjamin Deverman, Professor Viviana Gradinaru and the Gradinaru Laboratory at Caltech to develop novel AAV capsids that efficiently cross the blood-brain barrier and widely transduce, or transfer, genes into the CNS after intravenous administration. From these efforts, a new, second-generation AAV capsid provided up to a 100-fold increase in the transduction of the CNS in an adult mouse model over the historical standard, AAV9, as compared with the first-generation capsid reported last year by the Gradinaru group that provided a more than 40-fold improvement over AAV9. Key translational studies in non-human primates are underway by Voyager to evaluate these AAV-variant capsids that have the potential to transform our ability to deliver gene therapies to the CNS. Voyager obtained a co-exclusive license to the Caltech novel AAV capsids, intellectual property and related technology in September 2016. The license agreement covers all fields of use and includes novel AAV capsids that have demonstrated enhanced crossing of the blood-brain barrier for the potential treatment of CNS diseases following systemic administration of an AAV gene therapy vector.»

https://ir.voyagertherapeutics.com/node/7836/html

«Competing Interests
B.D. (Benjamin Deverman, min anmerkning) and K.C. are inventors on patents related to the AAV-PHP.B vectors filed by the California Institute of Technology; a provisional patent application related to this work controlled by the Broad Institute has been filed; B.D. is a consultant for Voyager Therapeutics and a member of the Scientific Advisory Board for Tevard Therapeutics. All other authors declare no competing interests. This does not alter our adherence to PLOS ONE policies on sharing data and materials.»

https://journals.plos.org/plosone/article/authors?id=10.1371/journal.pone.0225206

Man finner en lang rekke andre ting også. Patenter, forskningsartikler og sikkert masse mer. Jeg ble litt skuffet over at han ikke har fått en plass i scientific advisory board, men det kommer vel med tid og stunder.

3. slå opp på LinkedIn på vår CEOs profil (Michael AKoh)

Kikk på aktiviteten hans og finn posten han likte fra Voyager Therapeutics. Det omhandler oppstart av en studie med antistoffer mot TAU proteiner (som de finner ved demens). Full release her: https://ir.voyagertherapeutics.com/news-releases/news-release-details/voyager-therapeutics-announces-first-participants-dosed-single

4. Jeg er villig å vedde mye på at det ikke er tilfeldig at oppdragsforskeren Deverman som digger SAN med stor sannsynlighet har ledet meg til enda en ny AZT kunde, Voyager Therapeutics. Men det er Michael som på diskret vis trigget meg til å skrive det ned.

——

Jeg har for lengst sluttet å tro på tilfeldigheter.

I tillegg er jeg forbløffet over at Benjamin allerede i 2017 havnet på radaren til Voyager. Til orientering, ble SAN lansert i 2016. Så her er det pionerarbeid som endelig blir til noe.

Voyager spesialiserer seg på nevrologiske sykdommer. Og en av de tingene som trigger meg er at de har utlisensiert et capsid til Novartis. Om det er samme capsidet Deverman har jobbet med får bli det neste man får forsøke å finne ut av.

https://www.voyagertherapeutics.com/
JosefK
19.05.2024 kl 14:06 3237


Sino biologics er på handletur i Canada. Et lite selskap jeg ikke har hørt om før.

https://www.yicaiglobal.com/news/chinas-sino-biological-to-buy-canadas-signalchem-biotech-for-up-to-usd48-million
JosefK
27.05.2024 kl 22:20 2914

🤗🤭

Holy Diver 🤟🏻🤘🏻

Det er rimelig spesielt å sitte og lese om AZT og metodikk for å detektere kreft i magen og så dukker Ronnie james DIO opp… 👊🏻

Men det gjorde det altså her. Studien har nemlig fått støtte fra Ronnie James Dio Stand Up and Shout Cancer Fund. Litt spesielt. Jeg har faktisk sett DIO med Heaven and Hell (Toni Iommi). Men det begynner det å bli lenge siden. Jeg syntes bare det var litt sprøtt.

Studien brukte forresten DSDNASE og ble ansett for å være lovende. Og ser ut til å være et samarbeid mellom koreanske og amerikanske forskere.

https://link.springer.com/article/10.1186/s40364-023-00524-2
Redigert 27.05.2024 kl 22:24 Du må logge inn for å svare
JosefK
29.05.2024 kl 21:29 2720


Univercells husker nok mange av dere. Men Jeg kan ikke huske å ha funnet SAN i direkte tilknytning til dem tidligere. Unntaket er Exothera som så vidt jeg har skjønt er et underbruk. Men jeg kom over dette dokumentet i dag som har en skrivefeil som gjør at det unngår søk med mitt vanligste søk. Så der har vi endelig en direkte påvisning.

#SAN HQ
#Univercells

https://www.sumobrain.com/patents/wipo/Systems-methods-recovering-target-biomolecules/WO2024105226A2.html
JosefK
15.06.2024 kl 22:41 2198


Influensa vaksine produsert med M-SAN? Ja, sier disse forskerne. En nokså kompleks artikkel som skiller seg fra de normale virus vektor prosjektene jeg har lest hundrevis av. Her bruker de en virus-lik partikkel som vektor. Og i dette tilfellet er det et HIV virus som har stått modell.

#M-SAN
#influensa vaksine

https://www.frontiersin.org/journals/immunology/articles/10.3389/fimmu.2024.1425842/full

Jan Raa
16.06.2024 kl 17:28 2044

Rester av DNA fra produksjonssystemet var én av hovedårsakene til de alvorlige bivirkningene av mRNA-vaksinene, i tillegg til at spike-proteinet som virus-mRNA gir opphav til i kroppen, i seg selv er toksisk. Jeg er overbevist om at man før eller siden vil måtte gå bort fra bruken av mRNA-vaksiner på grunn av uforutsigelige bivirkninger. Men det er vanskelig på grunn av all prestisjen blant de ansvarlige for lanseringen av disse vaksinene og de enorme pengebeløpene som er lagt ned i produksjonsanlegg i mange land. Men uansett hva utfallet blir, er det tvingende nødvendig å unngå kontaminasjon av DNA. Til det formålet er SAN uovertruffet. Influensa-vaksinen som er beskrevet i artikkelen, er etter mitt skjønn uovertruffen og der har de benyttet SAN for å fjerne DNA, og skriver: "For removal of host cell DNA, a medium-salt active nuclease (M-SAN; ArticZymes) treatment was performed (31) according to the manufacturer’s instructions". Men innen denne kommersielle sektoren (den farmasøytiske) er det ikke fornuftige og medisinsk ansvarlige regler som nødvendigvis vinner fram
JosefK
18.06.2024 kl 13:15 1826


For en bra dag for vitenskap! En lliten preprint fra Boehringer Ingelheim er verdt å dvele litt ved. Den holdt på å forsvinne inn i glemselen på grunn av en noe rotete webdesign hos Science direct. Men her er det ting å bite seg merke i.

«Our results demonstrate that insertion of miRNA target sites into the 3’-untranslated region (UTR) of the transgene and simultaneous expression of the corresponding miRNA from the 3’-UTR of conventional AAV production plasmids (rep/cap, pHelper) enabled efficient silencing of toxic transgene expression, thereby increasing AAV vector yields up to 240-fold. This strategy not only allows to maintain the traditional triple-transfection protocol, but also represents a universally applicable approach to suppress toxic transgenes, thereby boosting vector yields with so far unprecedented efficiency.»

Det er en munnfull, men på meg virker 240x å være et realt gjennombrudd for å si det på godt norsk.

Ellers er det verdt å merke seg at denne gangen har de kjøpt SAN direkte fra AZ, i motsetning til tidligere da de har kjøpt vis Serva Electrophoresis. DET er en utvikling jeg liker.

Det er en ting til med denne preprinten som tyder på at Boehringer legger vekt på resultatet. Den skal nemlig publiseres i Cell. For hva det er verdt.

https://pdf.sciencedirectassets.com/315509/AIP/1-s2.0-S2329050124000962/main.pdf?X-Amz-Security-Token=IQoJb3JpZ2luX2VjEGoaCXVzLWVhc3QtMSJIMEYCIQDeHt5nh8BjhMx5vF7f0YPJlEDkDRmGhfpVLZBkRieerAIhAJaytmdbOL%2ByT9ERknlH3moBw922l4DoydqTJyavBKbFKrMFCBMQBRoMMDU5MDAzNTQ2ODY1Igwr7jxECDf%2FRoxTrBwqkAWUncnif%2BarNR6oWHnpZq9eRNkrICb0D8y0u5BFi2vxlb8zZTvZaHoCNuOLNwbfqfEcqJgY8BSHIb4FJZvHlkb5N990WNF8Cg%2FQbXtTblMx7RPNyjDvkXH9zQ2qNvxH3Hm4398Jx09eMfzTWAVkksvYSEXtEQHMayQewPZPd7xALFUDn8dAOwTjQt3guHEMfi9cGQTNk4nISYw1bMGFZP98AoeGMZDiWD98NZm2ZxAgPydT6rS08LuN%2FR%2BwtFpESJhG05II6jzPN7AFF%2FLNSKTzVL6P1zL1dqXxdST5X86BGzaFgGw4C8lqnX5HTYjIP0Buz5KYU0qM%2FXKnrmsDMp1eObL8RYSCMSwoDXo74ga7qND3%2BEm5j%2Fy975VV9cixg1jW87HTIHHYJ0UK1YnshOKFsLGOOzsp%2BryNgYQywqY0NBU4IU0MFTFIlfmoPWsITUhHX1288liLSg%2FrUOBsDrclS3NwAFr63agJpFCKOcVfk5%2F0r8%2B26In9dahjfBxNkmfJeApxz0TKpgZx5dJnEvmpUvt%2FhBS4gYD764QD%2B4g0ThyJldMmPbv4uMMRfDbmoTmy0qun9V8RLZLt9yzXbHgZNY7bj1xUun6dUEjSY%2FCfWBdkQ2DDBaJVeJHgKcBkY0O0ejCrGyOcEaZneoHpwaz9BqqcCmm0r8sEnzjO5YKWDuEHSqjrHZEU09kZ7%2Bvmej31juH7WWjAw08a4il1MvFtj2c1HQaezY6Qfl3MVNRy2x%2FRsSu7cwWMK4uM5BL22VLOxF8ntucqx8UarUSoDolouAmLFMDJK9hR2vVu0ngOHJCOVLI%2BR%2BORgl%2BsUuKuUJwY99eyT9yS92G%2F3ofehUtnxxGAVjeeem7iEikcaJt2ZTDUp8WzBjqwAcKd2oDvLToaaTcCcwlqaNd2oInhF0Oij%2FuFY4CQv6L8aoh%2F0tF4NVJwJTDNe%2FMaIK8TTGITcpmga1ttye56L%2FcqFE28BHZj0n601Vbnoy3VbLvOEtjxq79LmIWHkuGzND11b5srGFMrN%2FV0TBWKigxoaa9xG1rc3F0bgLQgpbpkoDpACg0PGgu0STXO%2FVF8OhcTtlpWHQyEA95mrCbqvfFhsZGDu2VvtACbujo5b3TI&X-Amz-Algorithm=AWS4-HMAC-SHA256&X-Amz-Date=20240618T103616Z&X-Amz-SignedHeaders=host&X-Amz-Expires=300&X-Amz-Credential=ASIAQ3PHCVTY5U7RKX6D%2F20240618%2Fus-east-1%2Fs3%2Faws4_request&X-Amz-Signature=4e7ac1511ca0296d61e3a8e6e419feb30874dbe13a5e562aae3f28cadb3925db&hash=477942f8490c38d995e8b9c2da054ddbe7cca4d08f3b4a341121609754bcb769&host=68042c943591013ac2b2430a89b270f6af2c76d8dfd086a07176afe7c76c2c61&pii=S2329050124000962&tid=spdf-5abe0be4-ad8f-42a0-ae17-81ef89c22e51&sid=20186532730f964ef29885e6e877632998cbgxrqa&type=client&tsoh=d3d3LnNjaWVuY2VkaXJlY3QuY29t&ua=14095d5b570205575d505d&rr=895aa3279db756cc&cc=no

JosefK
28.06.2024 kl 11:57 1372


Broad institute (se lengre opp 👆🏻 om Benjamin Deverman (som også har signert denne studien)). Studien omhandler såkalte Prion sykdommer (eksempelvis kreuzfeldt Jacobs syndrom). I en muse modell greide de å redusere misfolding av prion protein med 80%. Jeg holdt på å si som vanlig så gikk det med litt SAN til dette eksperimentet.

Dessverre ligger den bak betalingsmur, men jeg syntes det var såpass interessant at det hører hjemme her.

https://www.science.org/doi/10.1126/science.ado7082
JosefK
08.07.2024 kl 09:59 1078


Metagenomics er det lenge siden jeg har sett på. Og her er et veldig godt eksempel fra England. Det fine med den er at den er veldig instruktiv og har forbløffende gode resultater.

Noen av forfatterne er affiliert med Oxford Nanopore. Og for de som ikke liker å lese, HL-SAN er bidraget fra AZT 🤗

https://www.nature.com/articles/s43856-024-00554-3
JosefK
11.07.2024 kl 17:35 840


Dette ser ut som mat for AZT…

https://ct.catapult.org.uk/news/cgt-catapult-establishes-consortium-to-improve-aav-formulation

Hvorfor?

Mrs. Sharon Brownlow: With a background in Biotech and extensive experience in the cell and gene therapy industry, Mrs. Brownlow is renowned for blending her scientific roots with entrepreneurial drive. Her proven track record includes senior commercial roles in Catapult and Cobra Biologics, where she effectively drove strategic business momentum and long-term revenue growth.

Sharon er nyvalgt i styret.

Det passer ellers inn i det Michael har kommunisert det siste halvåret.

Jeg skyter med hagle her og håper jeg treffer. Men det er litt for mye sammenfall av roller, timing og sånt til at man lar være å fyre av et skudd…

AZT er og har lenge vært å finne som samarbeidspartner i Catapult:

https://ct.catapult.org.uk/how-we-work/our-collaborators
JosefK
17.07.2024 kl 00:32 567


Jeg har aldri sitert VG i denne forbindelsen tidligere. Ikke har jeg tenkt å la det bli en vane heller. Men når VG skriver om ting jeg har skrevet om tidligere, why not??

Olink er selskapet jeg omtalte da Thermo Fisher kjøpte dem for vel et halvt år siden. Og nå har VG sin vri på saken etter at oppkjøpet er godkjent. Og historien er søt den.

https://www.vg.no/nyheter/i/Pp47ab/solgte-selskap-tjente-26-milliarder
JosefK
18.07.2024 kl 18:26 324


En interessant Patentsøknad dukket opp på radaren min i dag. Dessverre er den uten figurer, så det er ikke så lett å se resultatet. Men de har brukt SAN og testet mot Benzonase spesielt, men de hinter også til andre endonukleaser.

Papiret er signert Lonza og de som ikke kjenner det igjen som verdens største CDMO (i hvert fall var de det🤭.)

#SAN #Lonza

https://www.sumobrain.com/patents/usapp/Process-preparing-extracellular-vesicles/20240241020.html