Anyway, jeg snublet over en preprint i dag som jeg fant interessant. Ikke fordi det har med kommersialiseringen av SAN å gjøre, men det har med metoden å gjøre. De brukte her SAN til å rense protein, noe man vanligvis ikke ser. Det vanlige er Virus eller virus-lignende partikler. Så jeg nappet like godt ut hele avsnittet om det er noen som interesserer seg for det. Jeg kan ikke huske å ha sett denne metoden tidligere, så det er mest for å prente det inn i hukommelsen.

fl-A3B and A3Bctd protein purification

Protein expression and purification as previously described with modifications.57 Briefly, using the standard Expi293 transfection protocol (ThermoFisher), 25 mL cultures of Expi293F cells (ThermoFisher) were transfected with pcDNA3.1-hA3Bi-mycHis or pcDNA3.1-A3Bctd (193-382)-mycHis. Transfection enhancers were added 18-20 hours post-transfection. Cells were harvested 3 days post-transfection by centrifugation at 1,000 rpm for 5 minutes; then the cell pellets were frozen at -80°C. Cells were thawed on ice, then resuspended in 15 mL lysis buffer (25 mM Tris-Cl pH 8.0, 500 mM NaCl, 5 mM MgCl2, 20 mM imidazole, 5% glycerol, and 0.1% IGEPAL CA-630), followed by sonication on ice for 2 minutes, at power 5 and 40% duty. RNase was added to 100 μg/mL, as well as 100 U of Salt Active Nuclease (MilliporeSigma), and incubated at 37°C for 2 hours for nucleases to act. Following centrifugation (16,000 x g, 30 minutes), clarified lysates were collected, and sodium chloride was added to a final concentration of 1 M. 100 mL Ni-NTA Superflow resin (Qiagen) was added to the lysates and incubated for 1 hour at 4°C with agitation. The resin was washed with 1 CV wash buffer (25 mM HEPES pH 7.4, 0.1% Triton X-100, 10% glycerol, 300 mM NaCl and 40 mM imidazole) and then incubated 3 times with 200 μL of an elution buffer (25 mM HEPES pH 7.4, 0.1% Triton X-100, 20% glycerol, 150 mM NaCl, 400 mM imidazole, and 1 mM TCEP) for 10 minutes to elute proteins. Elutions were then pooled and concentrated using an Amicon (MilliporeSigma) device with a 10 kDa cut-off before storage. Proteins were snap-frozen in liquid nitrogen and stored in 5 μL aliquots at -80°C. Once thawed, proteins were kept on ice for no longer than 24 hours and never refrozen.

Hele blekka kan leses her:

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.11.628032v1.full

Det er interessante tider. Og her om dagen dukket det opp enda en headscratcher. Faktisk så er det dere her får høre så bisart at jeg humrer over dem når jeg finner lignende ting. Men dette er annerledes og jeg vil anbefale å lese CVen til Peter Hortez før videoen. Den finner dere her;

https://www.bcm.edu/people-search/peter-hotez-23229

Straight type er det jeg leser. Men ta å hør gjennom det han presterer å si her:

https://rumble.com/v5w5jnq-dr-peter-hotez.html

Wooow… Jeg kommer ut av tellinga over hvor mange sykdommer han har på lager som kommer til å slå ut før …wai for it… ….20. januar. Og hva er det med 20. januar? Jo, selvfølgelig Donald Trumps gjeninnsettelse som president.

Det er mange wooow faktorer som slår inn i løpet av ett og et halvt minutt. Først og fremst at det er ingen med vettet i behold som ville vedde på at flere av disse sykdommene vil slå til med vel en måneds forvarsel. Ingen. Man skulle nesten tro han uttaler seg med innside informasjon. Det neste som slår meg er hvor politisert vitenskap og helse har blitt.

Jeg klarer ikke se for meg annet enn at hvis det går som Peter her sier, så er dette å se på som en trussel. For de som husker fem år tilbake i tid så var det Trump som fikk covid i fleisen, noe som han helt tydelig ikke visste hvordan han skulle håndtere. Er det det Peter vil fram til? Eller er det den sedvanlige nedsettende antivaxer narrativen som skal hamres igjennom nok en gang?

Jeg aner ikke.

Men jeg er 100% sikker på et par ting:
-hold AZT når alarmen går. I følge Peter er det 20. januar.
-styrk immunforsvaret. Vitamin D over 125 nmol/L er helt essensielt. Et tilskudd av sink daglig likeså. Og hvorfor ikke NBG 24:7 siden mange av oss har fartstid fra Biotec Pharmacon?

Det er uhyre spennende tider. Og når velskolerte, presumptivt oppegående personer kommer med det som kan høres ut som trusler, så er det all mulig grunn til å bite seg merke i hva som skjer.

Det var ikke meg som skrev dette. Ta gjerne å finn ut hvem som gjorde det, det er omtrent like morsomt som det som står der…

https://parsers.vc/news/241025-the-future-of-bioprocessing--arcticzymes/

Mer detaljerte nyheter:

https://reliefweb.int/report/democratic-republic-congo/disease-outbreak-news-undiagnosed-disease-democratic-republic-congo-8-december-2024

Right. Da er jeg rimelig sikker på at her rører det på seg. Hvis man har fulgt litt med på pandemi-nyhetene, vet man om «disease x». Det er selvfølgelig bare en placeholder sykdom som har eksistert i vel ett år. Men nå har den fått innhold.

https://eu.usatoday.com/story/news/health/2024/12/06/who-experts-investigate-congo-flu-mystery-disease/76820219007/

I google trends har den tatt over for fugleinfluensa:

https://trends.google.com/trends/explore?date=today%203-m&q=%2Fg%2F11f50xk6bq,%2Fm%2F03zx0w&hl=no

Jeg sier sjelden at man bør kjøpe aksjer. Det må bli opp til hver enkelt. Men jeg skal si det såpass sterkt at hvis man selger med et åpenbart nytt forsøk på å sparke i gang en ny pandemi, så har man ikke skjønt mye. WHO er desperat for å få i stand ny pandemi treaty, så at dette kom nå, er ikke overraskende.

Slår dette til så er det ny runde med «gratis penger» for AZT. Får følge med på dette.

Nok en analyse fra grand view reasesrch. Denne omhandler dnaser. Kvikke hoder skjønner da det er snakk om ds-Dnase og hl-dnase for AZT’s del.

Også her dukket det opp en liten detalj som får meg til å glise:

« By country, Norway is the fastest growing regional market and is projected to reach USD 2.7 million by 2030.»

Jeg trodde først det var noe som hang igjen fra den forrige analysen som omhandlet rna polymeraser. Men det var det altså ikke.

Les sånne markedsundersøkelser med store poser salt lett tilgjengelig.

https://www.grandviewresearch.com/horizon/outlook/dnases-market-size/global

Fremdeles fullstendig dødt på det store vide internettet.

Men det skjer ting som ikke er så innlysende. For de som fremdeles klarer å huske agendaen fra de to siste Q, så er oem aktøren(e) det sentrale det jobbes med for tiden. Og en av dem er en fortune 500 bedrift. Avantor sa jeg litt lenger oppe 👆🏻👆🏻 i tråden. Jeg måtte bare dobbeltsjekke at de faktisk er på fortune 500. Og I dag ble jeg ikke mindre mistenksom da jeg fant denne invitasjonen til et webinar i begynnelsen av desember:

https://informaconnect.com/celltherapy/agenda/2/#gene-therapy_novel-approach-to-optimization-of-aav-harvest-and-purification-process_10-30

Sparsommelig med informasjon, men det er sammenfall i tid.

Så det skulle ikke forundre om mysteriekunden er nettopp Avantor. Ingen stor bombe forsåvidt, de har lusket i kullissene i årevis. Men skal vi ta Michael alvorlig, noe vi antakelig bør gjøre, så er dette litt mer alvorlig enn en distribusjonsavtale. Dette er eksklusivitet og en fullstendig overførsel av produktet til en ekstern aktør.

Jeg ser ikke så mange andre aktører det kan være. Den mindre aktøren er det imidlertid fler som passer. En av dem har vært flittig å flørte i sosiale medier. Men det er fler som kan passe.

Vi får se. Jeg har aversjoner mot on-demand webinar, så jeg kommer nok ikke til å logge på. Men andre kan kanskje finne det Avantor finner på interessant.

PS. Tidligere gikk de under navnet VWR.

Med så lite å skrive om, så tyr jeg i dag til informasjon jeg vanligvis skyr som pesten. Ikke at jeg har noe imot disse markedsanalysene, de har nok en funksjon, men de blir litt som å finne fram i ukjent terreng utelukkende med bruk av kompass. Men det var en liten detalj gjemt langt nede i teksten som fikk meg til å glise:

«Country-wise, Norway is expected to register the highest CAGR from 2024 to 2030.»

Alright! Jeg lurer på hvorfor 🤔

Les for all del hele blekka, som for ordens skyld kun omhandler RNA polymeraser.

https://www.grandviewresearch.com/horizon/outlook/rna-polymerases-market-size/global

Man kan også svitsje mellom geografier i denne analysen. Nifty, men den blir nok ikke mer nøyaktig av den grunn 🤗

Kjedelig om dagen. Null nye, spennende patenter eller frisk forskning som kaster et blikk på hvor i verden og av hvem det forbrukes azt kjemi. Men det dukket opp en jobb for en Phd her i dag som er knyttet til tilskuddet som ble gitt for nesten ett år siden.

https://www.timeshighereducation.com/unijobs/listing/384041/phd-candidate-in-molecular-biotechnology/?LinkSource=PremiumListing

Dette er noe av det mest spennende jeg har lest på lenge. Jeg har kanskje hørt navnet en plass, men siden det er så generisk så er det som å kaste vann på en teflon panne 🙃

https://www.elementbiosciences.com/

I korte trekk er det en startup som tar mål av seg å hamle opp med Illumina. Men det er mer. For mye til å gi et kort resymé. Men jeg fant fram to publikasjoner jeg leste det meste av. Det er Nature artikkelen som virkelig gir meg food for thought. Patentet er bare med fordi jeg er genuint interessert i hva slags kjemi det er i «motoren» på maskineriet.

https://www.sumobrain.com/patents/us/Methods-generating-circular-nucleic-acid/12134766.html

https://www.nature.com/articles/s41587-023-01750-7

Det er tungt stoff. Så tungt at jeg sliter med en del konsepter. Men det er bilder å se på og de er forståelige.

Men hvorfor havner dette her? Jo, det er som vanlig kjemien. Og den er Element særdeles kryptisk når de omtaler den. Men det som kommer fram ved å lese patentet er bl a at den ene polymerasen som omtales stammer fra samme bakterium som Yvonne Pietrovsky har forsket på. Yvonne kommer fra Universitetet i Tromsø. Men det er hun ikke alene om. Og jeg mener NEB utvikler kjemi fra samme bakterium.

Men det var et morsomt dypdykk inn i en materie jeg ikke ante eksisterte. Og jeg må tilbake til Nanopore sekvensiering for å framkalle tilsvarende fascinasjon.

AZT ansatte «liker» Element. Om det er fordi de er like nerd som meg eller fordi de selger ISOPOL til dem, vet jeg ikke. Men jeg observerer. For så vidt ville det være usannsynlig at ikke Element kjøper kjemien vår slik majoriteten av de andre sekvensierings aktørene med litt clout gjør 🤗👊🏻 Spørsmålet er egentlig hva. I dette tilfellet tviler jeg på jeg finner detaljene, siden de holder kortene tett til brystet. Men kikk nå i det minste på bildene.

Som jeg sa, flatt. Og en tanke lavere. Brødteksten forklarer hvorfor.

ArcticZymes Technologies announces commercial strategic Transformation and Q3 2024 Financial results

Tromsø, Norway, November 6th, 2024 - ArcticZymes Technologies (OSE: AZT)
reported revenues of NOK 24.1 million and an EBITDA of NOK -2.3 million for the
third quarter of 2024.

Financial Highlights:

· Revenue for Q3 2024 was NOK 24.1 million, compared to NOK 31.2 million in Q3
2023. Year-to-date revenue totals NOK 81.7 million (9M 2023: NOK 90.6 million).
· Revenue for the quarter was in particular impacted by lower sales to two key
accounts.
· Biomanufacturing revenue has grown for the third consecutive quarter,
demonstrating resilience in a challenging macroeconomic environment.
· EBITDA for the quarter came in at NOK -2.3 million (Q3 2023: NOK 7.3
million), with a loss before tax of NOK -2.0 million. Year-to-date EBITDA stands
at NOK 2.6 million (9M 2023: NOK 20.2 million), and profit before tax at NOK 5.5
million (9M 2023: NOK 22.2 million).
· Operating expenses for Q3 were NOK 26.4 million, with NOK 1.2 million
attributed to the implementation of a new ERP system. Total operating expenses
for the first nine months reached NOK 79.1 million.
· ArcticZymes ended Q3 with a robust cash position of NOK 170 million,
alongside an additional NOK 72 million in low-risk interest rate funds.

Strategic Transformation & Growth Plan

ArcticZymes Technologies is advancing its strategic realignment, building on its
previous commercial initiatives to further strengthen its market position and
better meet the evolving needs of its customers. While the company has already
made strides in becoming more commercially oriented, the new Board of Directors
is working closely with management to accelerate and intensify these efforts.
This next phase of the strategy aims to transform ArcticZymes into a more agile,
solution-driven organization that can more effectively address the complex
challenges faced by its biotech and life sciences clients.

"This transformation is an extension of our ongoing efforts to enhance our
commercial capabilities, but now we are accelerating the process," commented
Michael Akoh, CEO of ArcticZymes Technologies. "The next stage phase involves
significantly strengthening and transforming our commercial organisation and
processes to better serve our clients.

Key Focus Areas in Development:

· Commercial Strategy: Building on past initiatives, the new Board and
management have jointly decided to accelerate the company's commercial strategy.
Together, they are committed to intensifying efforts to capture new market
opportunities, positioning ArcticZymes as a leader in delivering solutions that
address critical challenges for its clients in the life sciences sector.
· Strategic Investment: Costs and further investments to reinforce the
commercial team are being evaluated as part of the company's broader strategy to
increase customer focus. This continued investment in commercial capabilities is
key to driving ArcticZymes' vision of becoming a more customer-centric
organization.
· Problem-Solving Focus: ArcticZymes remains committed to its role as a
solution provider, helping clients overcome technical and operational hurdles.
This problem-solving focus, already embedded in the company's approach, will be
further enhanced through the ongoing transformation to maximize the impact of
its solutions in molecular diagnostics, research and biomanufacturing.

OEM Agreement and CDMO Progress: Discussions with key life science partners are
progressing well toward an OEM agreement for SAN, with potential term sheet
expected executed by late Q4 or early Q1 2025. In parallel, ArcticZymes is
actively collaborating with CDMO partners to incorporate its enzyme technologies
into viral vector platforms. Both SAN and M-SAN have received positive initial
feedback during evaluations conducted by a client CDMO. Favorable data from
these evaluations was recently presented at the ESGCT conference in Rome last
month. A significant step towards platform integration.

Commitment to Innovation: While the company continues to build on its commercial
foundation, innovation remains at the heart of ArcticZymes' strategy. A recent
publication in Nucleic Acids Research introduced a novel RNA restriction enzyme,
ET-N1, which has exciting potential in mRNA research and advanced therapies.
This prototype addition strengthens the company's portfolio and positions it for
future growth through diversification into advanced therapies.

Looking Ahead: With its enhanced commercial focus, strengthened leadership, and
clear roadmap, ArcticZymes is poised to build on the successes of the past while
taking decisive steps to accelerate its transformation. The company's leadership
is committed to finalizing and implementing this plan, ensuring that ArcticZymes
continues to deliver value to its clients and shareholders in the years ahead.

Dagen før dagen gjorde jeg et siste blikk på Q2 rapporten. Jeg bruker å gjøre det for å ha materien friskt i minne. Og det er mye som skjer. Og noe drukner også for meg som aktivt søker nyheter. Det som slo meg er prioriteringen av de to nye drug file (GMP) søknadene. SAN HQ GMP Neo er et produkt som har gått helt under radaren. Det er absolutt ingen som har nevnt det noen plass. Jeg kan ta feil, men jeg mener det en stund gikk under navnet SAN X. Men jeg mener det er verdt å merke seg at Neo har fått prioritet foran M-SAN GMP. Når man ser på publikasjonene fra ACIB og Oxford Biomedica, skulle man tro M-SAN var viktigere å få godkjent. Men nei, det er dette SAN produktet ingen har sagt så mye om som har prioriteten.

Jeg har en ide om hvorfor, men det bygger på en del gjetninger. Og den første gjetningen er at Neo egentlig er det Jethro kalte SAN 2.0. Og de som har minnet i orden, vil kanskje huske at Jethro nevnte at verdens største produsent av rekombinant protein ville bruke SAN 2.0 i alle sine produkter. Og jeg lurer på om det er dette som er årsak til prioriteringen. Jeg gjetter mye her, men jeg mener det gir mening. Jeg lurer også på om kunden er det britiske selskapet ABCAM. De ble kjøpt opp av Danaher ved årsskiftet. Det ble mye gjetninger her, men når jeg er i gang, så kommer det mye. Men det var en av de ansatte som var ute og «likte» noe fra ABCAM for en måned eller to siden. Det kan styrke teorien.

Anyway, Neo er planlagt å få drug file i inneværende kvartal, noe som skulle tilsi at M-SAN kommer i H1 neste år. Jeg tror det er holdbarhetsstudien som er den siste bøygen.

Men det er mye mer. Litt for mye for den lille tiden som er til rådighet. Håper på litt mer om ecotoxins 🤗

Hva økonomien angår, tipper jeg flatt som de ni siste kvartalene. Begrunnelsen er trenden og den er flat. Jeg endrer ikke holdning før jeg har grunn til det. Og flatt er bra. Det er likevel så mye i pipeline at det må bli forbigående. Og jeg tror ikke markedet har endret seg vesentlig siden Q2, så flatt it is… jeg skjønner ikke at folk ikke verdsetter denne stabiliteten. Jeg husker nemlig en gang i verden da hele AZT var prisgitt hva Thermo fant på. Det trenger man ikke bekymre seg for nå om dagen da det er noen flere bein å støtte seg på. Men jeg håper også at bunnlinja styrker seg litt sånn at året som helhet lander på rundt 20 mill på bunnen som i fjor. Uten at jeg tror det betyr så mye. Det viktigste er at markedet kommer opp av dvalen. Dvalen jeg ikke trodde skulle vare så lenge som da jeg første gang ble klar over den for to år siden.

Oxford biomedica er på hugget for tiden. Litt lenger oppe i tråden kan dere lese om posteren som fikk mye blest på LinkedIn. Men det var en preprint jeg har misset som kom for vel en måned siden. Den kan betraktes her:

https://download.ssrn.com/heliyon/41bcea71-11db-434b-aeee-e9428c013c21-meca.pdf?response-content-disposition=attachment%3B%20filename%3Dssrn-4929949.pdf&X-Amz-Security-Token=IQoJb3JpZ2luX2VjEB8aCXVzLWVhc3QtMSJIMEYCIQCPh4JJR9WzV9lJx78eWv8pCP9K%2BJ8x7olXLJ4HlHZlAAIhAML8ya3BFvATAxOviZI%2Frt6X3IRcR4tx37O%2BdbqmS3QxKscFCJj%2F%2F%2F%2F%2F%2F%2F%2F%2F%2FwEQBBoMMzA4NDc1MzAxMjU3IgwfISJeB%2F1Lwt%2BfIO4qmwVQs13yb6gGN9UuH4IlgugOa%2BlDDdNlVV77bqN%2BwHEAAviMHW2VjO736VfV6gKzG7DF3tBiBHUVUp9UkFBgrtAXKYm2hKy3yW3cHFDPTlpasFNV65m7%2BcXKK4ke3c%2FKYZPza0JAvgKKZR%2FK0p7GSpZLCB38XIGtdz4ucSXPpNef6l0jMzXypPqvqcIKAwE8utULqLpZwUl3%2BYq6CAWy1XYrDEmofCJ%2FZYOzcZVsUG4OorgxHhgvlUPl9r9IKmS%2Bkdq6OeEbj%2BH5600K3If4%2BgNurQAA%2FLPpQLIGc8OV%2F0FL6mCjfWAia3HBepywZ7peAkBGw4ycOaiI2ZmV45QCkA9UQcQs4i08c1EZG%2BolbaHUKXDc9U2XolRVCuMVfYPySkVftjlTyAkv9johMUvqOBHw6O9sY9J2pEjyYx02ib6ymAE6ewGyxqdIKnQ1JDUlhOkQCWwLCNrBQteRTsDCqUn6VO6kygGLzxtxl50%2BgCHMR9j2e8ls1msPxvQAeNIBYnoQJinURhDAPgZl67oR2G7zNb%2BscS4Yu0ZpG8Arq6DTuCfPVT1av2O2yWLae0Uxbw8qxmhRyzrK3avgrqYE2%2FnH45sX36OZp9E4QmyxCNcKfJEr9G%2FMzI8qPJIHsrvS8fNXDjhyvlQ3RXKGpKHb1JxyJqZ0XpIzGO5hwAky%2FsuYAitsLuU03b3lYCgftfasZytqe9cn6Nny%2FmfKQ4oeV0Hfp4jyPigNqCCf4kTHC05J19NDqPCaZO3mkdSVZPde2c%2FHIv06VnssQLuAeL0IJoct1VddwqD3snFwi3HtWFlIzyJo5RVMdqOylPfd8trDU0adt7GYQTOESuy62GxEorB4guQgnoOtrMNc9fktciunYcFeSfbURwmMq7TCMOONkLkGOrABhhwqGp%2Bl6hzVC1VNS3RbyqEEo38qWSHnaYGo%2F%2F5ft6kHpaGYrCIo3t3Feki8%2BbJnAEopUuiW9iSo%2FBW3tMTFN7rLWUKy%2FcXuh7PvtVhsRLMAtKGgbbn51Zmljeg53kpdDeKSrVmjeWRjSiaUNNAwAJOf%2B0orNhz8rkKBUKN%2BgamU1PhXFukZzjw2WJCT38k7vZ2jGu7UkUjjSfVyPscO5A4RXzkixMwSBGj579ye19o%3D&X-Amz-Algorithm=AWS4-HMAC-SHA256&X-Amz-Date=20241031T234119Z&X-Amz-SignedHeaders=host&X-Amz-Expires=300&X-Amz-Credential=ASIAUPUUPRWE63B57FVI%2F20241031%2Fus-east-1%2Fs3%2Faws4_request&X-Amz-Signature=43d01cf2f2634e118f2aa4b69eaaab8343b155abe61570b590c4daf5d5b0d5df&abstractId=4929949

Oups, litt lang lenke 🤗😂

Dette abstraktet dukket opp I dag. Jeg er for lat til å logge meg på for å lese hele. Jeg har en mistanke om at det kan være identisk med studiet jeg rapporterte to hakk opp 👆🏻👆🏻 får det ikke helt til å stemme med VLPer, så mistanken er svak. Jeg får heller ikke resultatet til å stemme overens, så det kan være verdt å trimme spam-filteret for å finne ut av det. Men noen andre får gjøre det, jeg har altfor mange som spammer meg ihjel.

For meg holder det med konklusjonen:

M-SAN performs significantly better in removing DNA in the form of chromatin compared to benzonase, improving VLP yield and purity. Plus, by performing M-SAN treatment before flow-through chromatography, the capacity of heparin affinity chromatography is improved by at least five-fold.

https://www.selectscience.net/resource/endonuclease-treatment-in-downstream-processing-of-virus-like-particles

Jeg har litt følelsen av at det er fremad i alle retninger i AZT for tiden.

Kveldens post har INGENTING med Azt å gjøre!

Den har derimot med SALT å gjøre! Og KREFT!

Det morsomme med å gjøre mye research er å se litt på hvor researchen sender en. Og i kveld var de sodium chloride som havnet i søkemotoren. Og opp dukker et voldsverk av en studie av salt i kreftsvulster. Og den var så interessant at jeg har lest nesten rubbel og bit. I korte ordelag, så bidrar salt til å drepe kreftceller gjennom aktivering av CD8 T-celler. Og om noen liker en morsom studie like mye som meg, er dette morsom lesning og en påminnelse om å vennlig avvise myndighetenes heksejakt på saltet. Spis heller mer av det. Anyway, les:

We have discovered that high NaCl concentrations in the extracellular microenvironment have a significant impact on cellular metabolism and enhance human CD8+ T cell effector functions through a Na+/K+-ATPase-dependent molecular mechanism. This leads to improved antitumor cytotoxicity in vitro and in vivo.

https://www.nature.com/articles/s41590-024-01918-6

Neste gang skal jeg begrense meg til AZT. Kanskje.

I ❤️ NaCl

Produksjon av mesling virus er relativt nytt for meg. Men tydeligvis er det også en ting 🤗

Uansett så er dette nok et studie der M-SAN blir testet mot Benzonase. Og igjen blir Benzonase gruset. Sammenfatningen som er relativt lett forståelig ser sånn ut:

Heparin ligands captured 81% of measles virus from M-SAN treated supernatant
•
Yield of affinity chromatography increased 44% after chromatin digestion
•
Measles virus was recovered with 62% yield and 22-fold reduction in dsDNA content

Hele studiet kan leses her:

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0021967324008446

Så større yield og et renere produkt. 22 ganger mindre DNA kontaminant… Og det med en relevant komparand, ikke en falsk en som et annet firma lanserte her om dagen 🤭

Fooooorfeeeerdelig lite som skier om dagen, så den rikeste kilden til tidbits rundt AZT er ukonvensjonelle. Men nå har de selv funnet ut av hva som skjuler seg i posteren som Oxford Biomedica annonserte i forbindelse med ESGCT som pågår i Roma i disse dager. Ryktet om at det kommer gode data for M-SAN har man kunnet observere et par dager allerede. Og her er de. Tatt med et ikke perfekt mobil kamera, men om man legger godviljen til så klarer man å lese noe av det:

https://www.linkedin.com/posts/arcticzymes-technolgies-asa_esgct2024-executivesummary-dnaclearing-activity-7254821487147188226-5CQQ

Jeg hadde mine anelser da jeg googlet Maria Kapanidou. Hun står nemlig i patentet OXB har for produksjon av lentivirus vektorer.

Så da har vi forklaringen på hvorfor CEO Dr. Frank Mathias har inntatt styreleder rollen i AZT.

Det forundrer meg at ikke flere ser dette. Mitt gjett er at M-SAN blir en industristandard for lentivirus vektorer. Alt som må til er DATA, noe som kom her og tidligere i høst i forbindelse med denne publikasjonen: https://www.arcticzymes.com/news/whitepaper-efficient-chromatin-removal-in-viral-vector-manufacturing-using-salt-active-nucleases

Litt mer fra akademia. Universitet i Gent er en gammel gjenganger i denne kategorien av kunder som jeg prøver å overse. De har jobbet med diagnostikk av kreft i flere år nå og har en rekke publikasjoner å vise til. Nå har de også søkt det patentert.

Dette dreier seg stort sett om såkalt liquid biopsy med kreft som viktigste indikasjon. Og for å få det til bruker de HL-dsdnase.

Les mer:

https://www.sumobrain.com/patents/wipo/Method-to-screen-diagnose-monitor/WO2024200811A1.html

Det skjer mye i akademia som jeg nesten aldri gidder å dra frem. San Raffaelle hospitalet i Milano er en av aktørene jeg har lest om med ujevne mellomrom. Og den siste patentsøknaden jeg finner som omhandler SAN, er faktisk fra dem.

Men nå skjer det ting. Hvis dere klikker dere inn på Michael’s profil på LinkedIn, så vil dere finne at han «liker» et innlegg fra Genspire. Og ganske riktig når man blar nederst på denne siden:

https://www.genespire.com/en/about-us/founders/

Så skjønner man at Genspire er der IP fra S.R. skal kommersialiseres.

Så da var det ikke bare bortkastet og dumt å følge med på hva San Raffaelle har drevet med de siste årene. For noe, om ikke alt, kommer til å havne i Genspire, som er det jeg finner det mest hensiktsmessig å omtale.

Hjemmelekse: søk opp alle papirer med San Raffaelle og SAN. Jeg tror jeg har lest det meste, selv om jeg aldri har sagt noe om det.

Det dukket opp to patent i dag. Den første er fra en akademisk institusjon, så jeg orker ikke bruke tid på den. Men den andre er en gammel kjenning, Flagship pioneering. Dere vet, de som eier Moderna. Nå er Flagship Pioneering bare et holding selskap som holder en masse mindre selskap og jeg sjekket første forfatter og fikk treff på at han har Ring Therapeutics som arbeidsgiver. Så jeg regner med at i praksis er det Ring som står for knowhow og Flagship administrerer.

Uansett, dette omhandler Annellovirus som vektor. Og i den forbindelse bruker de mSAN.

Les mer her:

https://www.sumobrain.com/patents/wipo/Anellovirus-constructs-comprising-recombination-sites/WO2024192268A2.html

Men SAN var tydeligvis ikke død…

https://newsweb.oslobors.no/message/627994

Et hyggelig, om enn noe keitete presseskriv. Keitete fordi linken til filen man gjerne vil lese, må man først laste ned presseskrivet som pdf før man finner en link som virker.

Jeg har den her:

https://cdn.prod.website-files.com/64d5ee31f6ef966121388e81/66e9a2fcf995c33cd0554eb3_SAN%20Paper%20A4%202024-09.pdf

Det er vanskelig å tolke dette på annen måte enn at SAN salget er på vei opp. Det burde det, siden dataene viser at man alltid har en SAN som gruser konkurransen.

I følge E24 har vi utviklet en saks…. Skulle tro vi gikk Nille i næringen….

Denne var for morsom til ikke å havne i arkivet.

ArcticZymes Technologies har utviklet «saks» for RNA-molekyler
09:26
Marianne Stensland
DEL
Bioteknologiselskapet ArcticZymes Technologies har utviklet et nytt enzym, som har fått navnet ET-N1. Dette muliggjør presis og kontrollert fragmentering RNA-molekyler, ifølge en børsmelding.
Teknologien beskrives som et type «saks» som gjør det mulig å bruke nye metoder for å analysere og syntetisere RNA-molekyler.
Resultatene er publisert i det fagfellevurderte tidsskriftet Nucleic Acid Research.

I told you so. 👆🏻👆🏻👆🏻

😎

https://newsweb.oslobors.no/message/627808

ET-NX husked dere helt sikkert. Den har figurert i presentasjoner siden i fjor. Og her er den med fullt navn: EcoToxN1🤓 man må bare gi seg ende over navnepolitikken 🤪

Men mine ramts til side, nå er det nå publisert et papir som karaktriserer nyvinningen.

In this publication we have focused primarily on analytical application of RNA restriction enzymes. Capping analysis of therapeutic mRNA is just one of many analysis applications where the sequence-specific endoribonucleases EcoToxN1, EcoToxN5 and BthToxN1 can make an impact (Figure 1 & 2). Poly(A)-tail analysis of the 3′ end of mRNA or RNA fingerprinting for the identification of different RNAs in a mixture based on specific fragmentation pattern (Figures 3 and 5) are just a small selection of analytic applications that these enzymes and its relatives can enable.

Besides their shown relevance in analytical applications, RNA restriction enzymes could open new roads and generate new and bold ideas for additional applications in the growing therapeutic RNA world. Albeit outside the scope of this publication, interesting ideas regarding new production methods of different RNA species are briefly discussed.

EcoToxN1 could be used in the manufacturing processes of RNA enabling novel and unique workflows. In production of RNA variants, EcoToxN1 could advance and simplify manufacturing of anti-sense-oligos (ASO), in situ probes, aptamer, ribozymes, siRNA, or miRNA. These short RNA pieces can be amplified as multiple copies in long IVT constructs separated by EcoToxN1 cleavage sites, creating long concatemers of RNA. Digestion of these long transcripts can result in an increase in production yield. Rolling circle transcription that could theoretically yield infinitely long IVTs of concatemers could be especially interesting to be combined with RNA restriction enzymes such as EcoToxN1.

Circular RNAs (circRNA) have gained a lot of attention in the past years due to their increased stability compared to linear mRNA (37–39). CircRNA construction can be enabled by combining EcoToxN1 with, for example, an RtcB ligase (40). RtcB ligase accepts 3′-phosphate groups as substrate for ligation. Concatemeric RNA transcripts divided by EcoToxN1 recognition sites can be cleaved uniformly resulting in single RNA units ready for ligation with RtcB ligase. A combination of an alkaline phosphatase and a standard RNA ligase such as T4 RNA Ligase 1 or R2D ligase (41) could substitute for RtcB as well.

The bacterial toxin–antitoxin systems are a noteworthy class of enzymes. The type III toxin–antitoxin systems and its representatives: EcoToxN1, EcoToxN5, BthToxN1, as described in this paper, along with the type II toxin–antitoxin systems consist of a set of toxins that are often RNases and show remarkable sequence and substrate specificity (42–44). The MazEF from the type II toxin–antitoxin systems, as an example, has been under intense investigations (44,45). The focus of applications of toxin-antitoxin systems has been so far in the field of antibacterial or antiviral strategies and possible applications in anti-cancer therapy (46). Biotechnological applications such as counter selection, containment control, in vivo bioluminescent imaging, single protein production, and targeted killing of pathogenic bacteria in microbiota are other applications of toxin–antitoxin systems (46,47). The true strength of the RNA restriction enzymes such as EcoToxN1 and its homologues could be in applications connected to RNA analysis and possibly RNA manufacturing.

Earlier attempts to generate sequence-specific RNases by fusing RNA-binding domains to RNA cleavage domains did not slice within the recognition sequence and could not cut very precisely (48).

While several RNA analytical methods have been developed for molecular biology applications, there is a demand for the introduction of alternative, orthogonal and simpler approaches. The simple ‘Cut and PAGE’ strategy that is enabled by the single-enzyme method with RNA restriction enzymes such as EcoToxN1 is better suited for fast and high-throughput quality assurance in RNA vaccines and RNA therapeutics research and development. Clearly, the possibilities of combining RNA restriction with other ways of nucleic acid analysis such as LC–MS are given and described copiously in the scientific literature (6,49).

Sequence-specific DNA restriction enzymes have been the work horse of molecular biotechnology for over 50 years. With the rise and the growing field of mRNA therapeutics and production, demands for novel enzyme tools that can manipulate and analyze RNA will follow. EcoToxN1 can simplify many of the existing workflows in RNA analysis and production and, like in the case with DNA restriction enzymes, might trigger the development of new ideas and applications for RNA restriction enzymes in the future.

https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkae779/7756578?rss=1&login=false

Jeg klipper og limer litt fra sosiale medier her. Dette innlegget er likt av Michael, og jeg trenger vel ikke tilføye at han er CEO. Lesere av roterommet vil sikkert huske hvorfor. I hvert fall er det et krav fra min side at folk husker slikt. Det er derfor jeg skriver det.

——

Spencer Knights innlegg

Vis profilen til Spencer Knight, grafisk
Spencer Knight
Shaping The Future of Cell & Gene Therapy
7t

𝐓𝐡𝐫𝐞𝐞 𝐂𝐆𝐓 𝐂𝐨𝐦𝐩𝐚𝐧𝐢𝐞𝐬 𝐌𝐚𝐤𝐞 𝐇𝐞𝐚𝐝𝐥𝐢𝐧𝐞𝐬:
Milestone Achievements This Week 👇

In a challenging funding landscape, it’s inspiring to see small biotech companies demonstrating resilience through milestone-based partnerships.

𝘏𝘦𝘳𝘦'𝘴 𝘵𝘩𝘳𝘦𝘦 𝘣𝘪𝘰𝘵𝘦𝘤𝘩𝘴 𝘢𝘤𝘩𝘪𝘦𝘷𝘪𝘯𝘨 𝘴𝘪𝘨𝘯𝘪𝘧𝘪𝘤𝘢𝘯𝘵 𝘮𝘪𝘭𝘦𝘴𝘵𝘰𝘯𝘦𝘴 𝘢𝘭𝘭 𝘪𝘯 𝘵𝘩𝘦 𝘴𝘢𝘮𝘦 𝘸𝘦𝘦𝘬:

1. Precision BioSciences received $13M from Imugene, including $9.75M cash, to support its gene-editing platform and its oncology program, azercabtagene zapreleucel (azer-cel).

2. Sonoma Biotherapeutics earned $45M from Regeneron for progress in developing Treg cell therapies to treat autoimmune diseases.

3. Voyager Therapeutics secured $15M upfront from Novartis, with up to $305M in potential milestones, for licensing its TRACER™ capsid technology used in gene therapy.

𝐖𝐡𝐲 𝐓𝐡𝐢𝐬 𝐌𝐚𝐭𝐭𝐞𝐫𝐬:

👉 These milestones are crucial for accelerating the development of innovation in CGT, it also secures immediate funding for small biotech companies, such as Precision BioSciences and Sonoma Biotherapeutics.

Ultimately, it's a great reinforcement of industry confidence by validating the science and effectiveness of treatments and strengthening partnerships with major pharmaceutical leaders such as Regeneron and Novartis.

What are your thoughts - do you see this as a strong indicator of progress?

——

Det er ikke så lenge siden jeg omtalte Voyager Therapeutics.

Legg sammen to og to. Hva sa Michael sist Q? Var det ikke noe om partnering? Var det ikke noe om CDMO? Plattformer?

Når alle puslespill bitene er vendt, kantene lagt, er det mye lettere å se en del av motivet. Les om igjen min investigation av Voyager. Og de som fremdeles har IQ, vil vite at jeg indirekte har omtalt voyager i minst to år.

Takk, Michael. Jeg sover i ro fremdeles.

Dette er en vitenskapelig artikkel med stor troverdighet, og som gjelder et forbedret, tradisjonelt vaksinekonsept uten de alvorlige bivirkningene som utvilsomt er forbundet med mRNA-vaksiner. Siden ingen av de dominerende vaksineselskapene står bak studien - og finansiert den - er den å stole på. Det er overbevisende at det er brukt SAN fra AZT for å fjerne rester av DNA. Det brydde verken Pfizer eller Moderna seg om. Men siden det er disse selskapenes pengemakt som dominerer både media og myndigheter, er det liten grunn til å forevente at et bedre vaksineprodukt vil se dagens lys, selv om det gir bedre sykdomsbeskyttelse, hindrer smittespredning og til overmål har færre alvorlige bivirkniner. Det er den nakne sannhet.

Er der mulig å lage en bedre influensa vaksine?

Jeg holdt på å si «gamle venner» fra Østerrike -noe som ville vært misvisende, men de føles litt som gamle venner siden jeg har lest papirene deres utallige ganger tidligere. Utvilsomt noe av det beste av forskning har kommet fra denne kanten. Også denne gang er det proteiner de sysler med, nærmere bestemt VLPer (virus-like particles). Og denne gang er det M-SAN som er ArcticZymes’ bidrag.

Vel verdt å lese om man har interesse. Jan vet jeg har det. 🤓

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0264410X24009526

Avantor! Selvfølgelig er det dem. Jeg visste ikke de var på Fortune 500 listen.

Men det stemmer med den flørtingen jeg har observert i det siste. Avantor (tidligere VWR) har hatt AZT ensymer i over 10 år. Kan huske dem fra gamle presentasjoner.

Q2

Enda et kvartalsresultat langs linjal streken som er trukket på 30 mill, +/- 10%. Ikke uventet. Men jeg venter på bruddet. Og jeg venter det kommer snart, begrunnet både i marked, interne prosesser og den neste pandemien (som er her).

De interne prosessene, bør vel være nokså kjent, 2 ekstra GMP sertifiserte SAN nukleaser, pipeline produkter (se patent filing. Ovenfor 👆🏻👆🏻) og dagens «nyhet» om at det jobbes med to konkrete OEM aktører. Jeg er rimelig sikker på jeg vet hvem den ene er. Jeg tror det er Thomas Scientific. Det har vært en del flørting med dem i det siste. De har også en rekke AZT produkter fra før, så helt fremmed er det ikke. Den andre, en fortune 500 bedrift er det bokstavelig talt få å velge mellom, jeg kommer i farten på kun to innen Life Science og det er Thermo og Danaher. Mulig det finnes fler, men da må jeg lese litt mer.

Konstnadskontrollen er god og jeg noterer at Michael har agert riktig da han la ned Oslo avdelingen.

Som forventet er et greit resultat vær og føreforhold tatt i betraktning. Men det varer ikke evig.

Bridge Bio tror jeg jeg har nevnt tidligere, men jeg husker ikke når eller i hvilken forbindelse. Uansett, de er ute med en ny preprint som omhandler adenovirus plattformen de utvikler. Relativt sett ser det ganske bra ut, men det er vanskelig å forholde seg til iom at man ikke kjenner baseline. Men det ser fint ut. Og ja, de bruker SAN.

Nå er ikke Bridge verdens største, men de har en del partnere med på laget, hvorav Bayer er mest kjent.

https://www.cell.com/molecular-therapy-family/methods/pdf/S2329-0501(24)00136-0.pdf?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS2329050124001360%3Fshowall%3Dtrue

Jepp! Dette patentet ble publisert i dag. Den mystiske endoribonucleasen som har blitt omtalt under en arbeidstittel det siste året. Da er vi ett skritt nærmere launch tenker jeg 🤓

#ArcticZymes

https://www.sumobrain.com/patents/ep/Compositions-comprising-sequence-specific-endoribonuclease/EP4414460A1.ht

Endoribonucleases are a group of enzymes that cleaves internal phosphodiester bonds between adjacent nucleotides of RNA in either single-stranded RNAs or double-stranded RNAs depending on the enzyme. The endoribonuclease may be sequence specific (e.g. restriction endoribonucleases) or sequence independent.

A number of endoribonuclease enzymes are known, such as for example RNase H which is a family of sequence independent endoribonucleases that catalyse the cleavage of RNA in an RNA/DNA hybrid substrate.

Endoribonuclease enzymes have several applications within molecular biology research. For instance, removal of RNA in DNA extraction processes and recombinant protein purifications, cDNA synthesis, RNA fingerprinting, and detection of RNA modifications, e.g. 5'capping of mRNA.

Therapeutic RNA molecules such as mRNA molecules encoding antigens for vaccine production, represent an emerging class of drugs. Successful protein expression from transfected mRNA depends in addition to transfection efficiency also on mRNA stability and translation efficiency. 5'cap structure and 3' poly(A) tail are important features for obtaining high translation efficiency. Efficient methods for determining 5'capping efficiency of mRNA or other RNA modifications is therefore highly desirable.

Analytical methods such as gel electrophoresis, ion-pair reverse-phase high-performance liquid chromatography (IP RP HPLC) or mass spectrometry (MS) are commonly used for analysing RNA modifications.

However, identification of capping completeness of long RNA molecules, i.e. RNA molecules longer than 5-10 ribonucleotides is problematic because capping results in only a small shift in molecular weight of approximately 600 Da, which equals roughly to one ribonucleotide. Such small shift in molecular weight prevents a direct down-stream gel-based or mass spectrometry (MS) analysis of long mRNA molecules due to poor resolution.

Alternative capping molecules result in different products exhibiting only small shifts in molecular weight: e.g. Cap-1 or Cap-0, 5'-triphosphate, 5'-diphosphate, unmethylated G-cap, reverse cap.

In order to overcome the problem with poor resolution of existing current analytical tools, RNA samples and in particular samples comprising long RNA molecules need to be cleaved into shorter fragments before further analysis.

Today's standards for cleavage of RNA are endoribonuclease-based cleavage with either enzymes with high cutting frequency, such as RNase I, RNase H-based methods, ribozyme-based methods, or DNAzyme-based approaches.

Endoribonucleases with high cutting frequency like RNase I cleaves single stranded RNA after each G. Such enzymes are not optimal for certain RNA analysis methods since they lead to a high degree of fragmentation.

RNase H which cleaves a RNA/DNA hybrid is dependent on specific DNA-hybridization,

AU2016297778 , and RNase H-based methods have problems with unspecific and incomplete cleavage of target RNA even if the DNA probe is correctly hybridized. Therefor RNase H-based methods requires optimalisation of conditions for each hybridized RNA-DNA oligonucleotide pair in order to achieve complete and specific digestion of the RNA.

The Csy4 endoribonuclease is dependent on a guide RNA for recognition and cleavage of its RNA target sequence.

Just recently, ribozymes have been described to be applicable for sequence-specific cleavage of mRNA as well, Vlatkovic et al., Ribozyme assays for quantifying the capping efficiency of in vitro transcribed mRNA, Pharmaceutics 2022, vol.14, no.2, p.328 , and

WO2015101416 .

However, ribozymes rely of synthesis of ribonucleic acids and need to be used in 1-10-fold excess over the concentration of the substrate to be analysed. Ribozymes are catalytic RNA molecules and are thus more expensive to produce and also more challenging to work with due to lack of stability.

DNAzymes are DNA oligonucleotides with catalytic activity, similar to ribozymes. The most abundant class of deoxyribozymes are ribonucleases which catalyse cleavage of a ribonucleotide phosphodiester bond, Hengesbach, M. et al. Use of DNAzymes for site-specific analysis of ribonucleotide modification, RNA 2008, vol.14, no.1, p.180-187 .

Despite the existence of endoribonucleases there is a continued need for providing further endoribonucleases which permit efficient and simplified methods for RNA analysis or RNA synthesis that overcome one or more of the disadvantages of the endoribonucleases and the methods of prior art.

The inventors have surprisingly and for the first time shown that a sequence specific endoribonuclease ToxN from Type III toxin-antitoxin systems cleaves single stra

Illumina har levert tall. Og siden de sliter med Grail og store avskrivninger, er det ikke så interessant. Men når man ser på consumables (som er relevant for AZT) så øker det på. Og spesielt i den nye Novaseq X platformen som drar volum.

https://s24.q4cdn.com/526396163/files/doc_earnings/2024/q2/generic/Summary-of-Prepared-Remarks-2024-Q2.pdf

Ben Deverman (og Broad Institute) har jeg snakket om før. I den forbindelse var det AAV capsider for å trenge inn i sentralnerve systemet som var greia. I går landet denne artikkelen der de ved hjelp av maskinlæring har økt penetrering av lever med opp til 1000x.

Ben bruker fremdeles SAN.

https://www.nature.com/articles/s41467-024-50555-y

En interessant Patentsøknad dukket opp på radaren min i dag. Dessverre er den uten figurer, så det er ikke så lett å se resultatet. Men de har brukt SAN og testet mot Benzonase spesielt, men de hinter også til andre endonukleaser.

Papiret er signert Lonza og de som ikke kjenner det igjen som verdens største CDMO (i hvert fall var de det🤭.)

#SAN #Lonza

https://www.sumobrain.com/patents/usapp/Process-preparing-extracellular-vesicles/20240241020.html

Jeg har aldri sitert VG i denne forbindelsen tidligere. Ikke har jeg tenkt å la det bli en vane heller. Men når VG skriver om ting jeg har skrevet om tidligere, why not??

Olink er selskapet jeg omtalte da Thermo Fisher kjøpte dem for vel et halvt år siden. Og nå har VG sin vri på saken etter at oppkjøpet er godkjent. Og historien er søt den.

https://www.vg.no/nyheter/i/Pp47ab/solgte-selskap-tjente-26-milliarder

Dette ser ut som mat for AZT…

https://ct.catapult.org.uk/news/cgt-catapult-establishes-consortium-to-improve-aav-formulation

Hvorfor?

Mrs. Sharon Brownlow: With a background in Biotech and extensive experience in the cell and gene therapy industry, Mrs. Brownlow is renowned for blending her scientific roots with entrepreneurial drive. Her proven track record includes senior commercial roles in Catapult and Cobra Biologics, where she effectively drove strategic business momentum and long-term revenue growth.

Sharon er nyvalgt i styret.

Det passer ellers inn i det Michael har kommunisert det siste halvåret.

Jeg skyter med hagle her og håper jeg treffer. Men det er litt for mye sammenfall av roller, timing og sånt til at man lar være å fyre av et skudd…

AZT er og har lenge vært å finne som samarbeidspartner i Catapult:

https://ct.catapult.org.uk/how-we-work/our-collaborators

Metagenomics er det lenge siden jeg har sett på. Og her er et veldig godt eksempel fra England. Det fine med den er at den er veldig instruktiv og har forbløffende gode resultater.

Noen av forfatterne er affiliert med Oxford Nanopore. Og for de som ikke liker å lese, HL-SAN er bidraget fra AZT 🤗

https://www.nature.com/articles/s43856-024-00554-3

Broad institute (se lengre opp 👆🏻 om Benjamin Deverman (som også har signert denne studien)). Studien omhandler såkalte Prion sykdommer (eksempelvis kreuzfeldt Jacobs syndrom). I en muse modell greide de å redusere misfolding av prion protein med 80%. Jeg holdt på å si som vanlig så gikk det med litt SAN til dette eksperimentet.

Dessverre ligger den bak betalingsmur, men jeg syntes det var såpass interessant at det hører hjemme her.

https://www.science.org/doi/10.1126/science.ado7082

Og så ansettes det litt. Godt.

https://www.finn.no/job/fulltime/ad.html?finnkode=358663101