ArcticZymes fra PCR til lamp?
Du har kanskje lest om det. Polymerase Chain Reaction (PCR) beskrives som gullstandarden innen testing av Covid19. Og ja, PCR er bra. Gjort riktig så er det både nøyaktig, fleksibelt og mulighetene for å batch prosessere er riktig gode. Men det har sine begrensninger også. Utstyret som trengs er tungt, krever en del tid (opp til flere timer) og har en nokså høy inngangsterskel både med henblikk til materiell og personell.
Når det er sagt, er metoden gjennomprøvd og utstyret som brukes utbredt. Men hva om man kunne gjøre det enda enklere?
Det er det en hel del som forsker på nå. Og en brennhet kandidat til å ta en del av markedet er loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP)
Jeg har plukket ut en av flere studier som har kommet i det siste. Den har ingenting med ArcticZymes å gjøre i det hele tatt, men jeg valgte den fordi den er relativt enkel å forstå.
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.04.21.052530v1.full
Kort fortalt er LAMP mindre krevende fordi reaksjonene skjer på lavere temperatur og dermed gjør utstyret lettere. Avlesningen i dette tilfellet skjer ved at positive prøver skifter farge. Og reaksjonen tar mye kortere tid enn for PCR som har fler steg og avlesning på skjerm/utskrift.
Alt i alt så tror jeg LAMP passer mye bedre i felt enn det meste annet. Det kommer nok ikke til å erstatte PCR på veldig mange år, men det har etter min mening en naturlig plass når det er dårlig tid og det er langt til nærmeste lab.
Men da er vel ArcticZymes utkonkurrert?
Nei, langt ifra. ISOPOL familien av ensymer er såkalte isothermal polymeraser. Jethro har fortalt om forsøk som er gjort med denne teknologien og zika virus. Dessverre har jeg ingen referanser på det.
ArcticZymes er et lite skattekammer av muligheter. Isopol er en av de man har hørt mindre om. Hvor lenge varer det? Er det ingen studenter i Tromsø som får blod i kjeften av muligheten til både å gjøre noe med Covid-hysteriet og å gjøre et supert eksperiment samtidig?
Les litt mer om Isopol da vel:
https://30vxoi3p60e618bbpw1y53j8-wpengine.netdna-ssl.com/wp-content/uploads/2018/12/isopol-11302018-11.pdf
Når det er sagt, er metoden gjennomprøvd og utstyret som brukes utbredt. Men hva om man kunne gjøre det enda enklere?
Det er det en hel del som forsker på nå. Og en brennhet kandidat til å ta en del av markedet er loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP)
Jeg har plukket ut en av flere studier som har kommet i det siste. Den har ingenting med ArcticZymes å gjøre i det hele tatt, men jeg valgte den fordi den er relativt enkel å forstå.
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.04.21.052530v1.full
Kort fortalt er LAMP mindre krevende fordi reaksjonene skjer på lavere temperatur og dermed gjør utstyret lettere. Avlesningen i dette tilfellet skjer ved at positive prøver skifter farge. Og reaksjonen tar mye kortere tid enn for PCR som har fler steg og avlesning på skjerm/utskrift.
Alt i alt så tror jeg LAMP passer mye bedre i felt enn det meste annet. Det kommer nok ikke til å erstatte PCR på veldig mange år, men det har etter min mening en naturlig plass når det er dårlig tid og det er langt til nærmeste lab.
Men da er vel ArcticZymes utkonkurrert?
Nei, langt ifra. ISOPOL familien av ensymer er såkalte isothermal polymeraser. Jethro har fortalt om forsøk som er gjort med denne teknologien og zika virus. Dessverre har jeg ingen referanser på det.
ArcticZymes er et lite skattekammer av muligheter. Isopol er en av de man har hørt mindre om. Hvor lenge varer det? Er det ingen studenter i Tromsø som får blod i kjeften av muligheten til både å gjøre noe med Covid-hysteriet og å gjøre et supert eksperiment samtidig?
Les litt mer om Isopol da vel:
https://30vxoi3p60e618bbpw1y53j8-wpengine.netdna-ssl.com/wp-content/uploads/2018/12/isopol-11302018-11.pdf
Redigert 21.01.2021 kl 01:55
Du må logge inn for å svare
JosefK
11.05.2020 kl 17:40
1386
Hmmm....
Denne dukket opp på radaren min i dag. Er ikke riktig sikker på hvordan den skal tolkes eller om det i det hele tatt er verdt å nevne. Uansett, det skjer ting rundt ArcticZymes og dette er personer knyttet til ISOPOL og Exo ensymene.
Artikkelen ble publisert i august i fjor så jeg tror ikke det har med ISOPOL å gjøre i det hele tatt, selv om det er en mulighet for det.
Uansett: spennende lesning.
https://link.springer.com/article/10.1186/s12860-019-0216-1
Redigert 21.01.2021 kl 01:55
Du må logge inn for å svare
JosefK
09.07.2020 kl 11:11
937
Jeg vil anbefale dere å lese denne komparative øvelsen de har lagt ut.
https://arcticzymes.com/applications/isothermal-NA-amplification/
ISOPOL er som skapt for corona. Velprøvd teknologi uten fiksfakseri.
Redigert 21.01.2021 kl 01:55
Du må logge inn for å svare