Portugisiske Horta-Osório hadde sittet i stillingen i mindre enn et år. Det blir styremedlemmet Alex Lehmann som tar over midlertidig i Sveits' nest største bank.
– Jeg beklager at mine handlinger som privatperson har ført til vanskeligheter for banken og brakt min evne til å representere banken i fare, uttaler Horta-Osório.
Bruddet på sveitsiske karanteneregler skal ha skjedd etter en reise i desember. BBC skriver at han også skal ha brutt britiske karanteneregler i sommer.
Avgangen skaper ytterligere et problem for banken, som tapte milliarder av kroner i datterselskapene Greensill og Archegos i fjor. Horta-Osório ble ansatt blant annet fordi han hadde klart å snu skuta i britiske Lloyds.